医院注重学科建设和人才培养，以科技提高医疗质量，促进医院可持续发展。拥有国家重点学科2个[内科学（传染病），外科学（普外）]，浙江省重点学科4个（内科学、外科学、肿瘤学、口腔临床医学），浙江省医学重点学科群1个（器管移植学科群），浙江省医学重点学科17个，浙江省中医药重点学科8个。 传染病学科以病毒性肝炎诊治、艾滋病等新发与再现传染病研究、感染微生态学以及传染病诊断新技术、抗菌素应用见长。特别是学科带头人李兰娟院士等构建了一种将非生物人工肝和生物人工肝结合的新型混合型人工肝支持系统，显著提高重型病毒性肝炎治疗效果。急性、亚急性重型肝炎治愈好转率从11.9%上升至78.9%，慢性重型肝炎治愈好转率从15.4%上升至43.4%，许多病人经人工肝治疗后不仅摆脱了死亡的阴影，而且重返工作岗位，最长存活病例已达20年以上。 肝胆胰外科是国内规模最大、设施最先进、提供全方位医疗诊治服务的肝胆胰外科中心。在肝癌、胆管癌、胰腺癌、重型胰腺炎等综合治疗方面处国内领先水平，每年肝切除例数超过800例。肝移植中心是国内规模最大的器官移植中心之一。学科带头人郑树森院士至今已主刀完成肝移植900余例，包括全国最小年龄婴儿活体肝移植、国内首例成人扩大右半肝活体肝移植及高龄患者肝移植。目前良性终末期肝病患者术后1年生存率95.2％，达到国际先进水平。肝肾联合移植患者存活时间12年创全国最长纪录，胰肾联合移植患者已存活17年，创造并保持亚洲最长纪录。 血液病科采用综合治疗方法，治疗各类白血病一直处于国内领先水平。此外，擅长恶性组织细胞病、骨髓增生异常综合征等血液系统恶性肿瘤及血小板减少性紫癜、各类贫血等诊治。骨髓移植中心非亲缘异基因骨髓移植技术目前处国内领先水平，临床开展总例数国内最多。肾脏病中心肾移植技术目前处国际先进水平。该科在国内首创移植内外科结合，中西医结合，肾病的早期诊治、延缓肾衰、肾脏替代和移植的肾脏病一体化治疗。应用连续性肾脏替代疗法抢救危重病的技术处国内领先水平。此外，心内科在省内率先开展介入性心脏疾病诊断和治疗，在射频消融术治疗心律失常方面疗效显著，达到国内先进水平。心胸外科擅长心脏瓣膜置换、肺癌的诊治，体外循环心脏直视手术成功率高，达到国内先进水平，近年来开展了多种心脏病的微创手术，并成功开展心脏移植及心肺联合移植手术。泌尿外科在泌尿系肿瘤的诊治、尿路结石的体外碎石、男性学临床研究等治疗方面有独到的经验。消化内科擅长内窥镜诊治消化系统疾病及胃癌、消化性溃疡、胃肠功能障碍等治疗。呼吸内科在移植后难治性肺部感染、急性呼吸窘迫综合征、肺癌的早期诊断、胸腔积液的病因诊断、耐多药结核病、难治性哮喘等方面有深厚造诣。在省内最早开展支气管镜检查，诊治水平与数量全国领先。肛肠外科在结直肠手术、造瘘术、内外痔诊治等方面成绩显著。微创外科中心微创手术应用范围省内最广，久负盛名。
医院秉承“严谨求实、科教强院、规范服务、管理增效”的宗旨，先后获得省先进医院、省、市文明医院、全国卫生系统先进集体、全国百佳医院、全国卫生文化建设先进单位等多项殊荣。 荣誉称号[省部级以上] 1988年获浙江省文明医院称号 1995年获全国卫生系统先进集体称号 1997年获全国卫生文化建设先进集体 1998年获省级综合治理先进单位 1999年获全国百佳医院称号 1999年获卫生部抗洪抢险救灾防病先进集体称号 1999-2000年获省级综合治理先进单位称号 1999年获全省卫生系统思想政治工作先进集体称号 2003年获中国科教文卫体工会系统抗击非典先进集体称号 2003年获浙江省抗击“非典”先进集体称号 2005-2007年度荣获全国医院管理年活动先进单位 2007年荣获浙江省卫生应急工作先进集体称号 2008年荣获全国医德建设先进集体 2008年荣获全省卫生系统汶川大地震抗震救灾先进集体 2009年获“全国医药卫生系统先进集体”称号
